El hecho de que el guepardo se reproduzca a una velocidad tan lenta resulta en una gran preocupación para los investigadores, los estudios muestran que los machos, a menudo, sufren de baja producción de espermatozoides. Esto significa que incluso cuando se aparean con éxito no tienen una alta probabilidad de que nazca un cachorro. En cautiverio la velocidad de reproducción es también muy baja, existen programas de mejoramiento, pero no parecen estar ayudando tanto como esperábamos.
Otro factor que a los expertos les preocupa es que el guepardo posee una composición genética muy similar, no existe variedad cuando se trata de los genes que pueden pasar a su descendencia. Cuando tomamos en cuenta que cada vez menos de ellos permanecen en estado salvaje, nos damos cuenta de que cada vez están más y más relacionados entre sí. Como resultado, graves defectos y otros problemas son cada vez más comunes entre población actual.
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